1、微生物污染
　　微生物包括细菌、藻类、真菌和病毒等。细菌的颗粒极小，普通球菌直径为0.5～1.0微米；杆菌宽1微米，长2微米，病毒则更小，目前发现的最大的是痘病毒直径约300纳米，最小的是圆环病毒直径17纳米。微生物污染对反浸透膜系统至少形成两方面的不良结果：第一，微生物的大量繁衍和代谢，产生大量的的胶体物质，致使膜被梗塞形成膜通量急剧降落；第二，将形成产水中的细菌总数的增加。反浸透膜的微生物污染对整个安装的长周期运转极为不利，因而要对反浸透膜的微生物污染高度注重。
　　形成生物污染的缘由普通有： 
　　(1)进水中含有较高数量的微生物； 
　　(2)系统的停用、维护、冲洗等没有严厉依照技术手册请求停止； 
　　(3)没有对进水停止杀菌或者杀菌剂投加量过小；
　　(4)进水水质含有容易滋生微生物的营养物质从而招致微生物的大量滋生； 
　　(5)没有对管路停止定期的杀菌和消毒。遭到微生物污染的膜外表会非常滑腻并常有难闻的气息，对生物膜样品停止燃烧的气息同燃烧头发一样。 
　　(例如进水的氨氮指标严重超浓度，招致管路中和膜元件内大量微生物滋生，对膜系统停止化学清洗后，由于没有对管路停止杀菌消毒，系统启运时，在管路中存留的大局部微生物颗粒随水流全部进入膜端，招致系统产水率严重降落，膜段间压降急剧上升。系统最终经过离线清洗得以消弭污染。)
　　2、 有机物及矿物油污染 
　　由有机物形成的膜系统毛病占全部系统毛病的60%—80%。进水中的有机物吸附在膜元件外表，会形成通量的损失，特别是在第一段，在很多状况下，在膜外表构成的吸附层对水中的溶解盐就象另一层别离阻挠层，梗塞膜面通道，招致脱盐率上升，大分子量并且带有疏水性基团的有机物常常会形成这种效应，例如微量的油滴、大分子量难降解的有机物等，会招致膜系统遭到有机物污染。 
(例如石化废水成份复杂，水中有机物浓度较高， 且含有微量油，因而在石化废水深度处置安装中运用的反浸透膜系统中，有机物污染是一种最常见的污染类型。对反浸透膜的有机物污染普通经过进水的油和有机污染物浓度剖析即可判别普通的有机污染经过定期的化学清洗即可消弭。)